Como ya todos saben se acerca cada día más el final de este primer semestre del año académico 2008-2009. Los exámenes finales están a la vuelta de la esquina y ya debemos de estar concluyendo nuestro trabajo en los proyectos de investigación. En la entrada del mes anterior comenté que estaba enfocada trabajando con la amplificación del gene pufM. Logré amplificar el gene, utilizando tanto los primers que producen un fragmento ~200bp como el que produce ~1,500 bp. Por lo que se demostró, de foma molecular, la presencia de las bacterias fototrofas anoxigénicas, tanto en los cultivos líquidos, como en las muestras de aguas originales. Otra cosa que se logró durante este semestre fue poder obtener colonias de estos organismos, ya que siempre los habíamos cultivado en líquido, ahora tenemos colonias de ellos. Sabemos que son ellos, ya que en condiciones anóxicas producen pigmentación espectacular. Podemos verlos rojos oscuros. De tres colonias iniciales que habían pigmentado se hicieron una subcultivación y tenemos placas enteres de ellas. Esto fue un hecho que nos va a facilitar un poco el poder aislar en un medio de cultivo estas bacterias. En placas ellas crecen más rápido que en los cultivos líquidos, aunque seguimos haciendo transferencia de los mismos, para no perderlos. De estos últimos se han hecho extracción de pigmentos y con espectrofotometría se ha demostrado que la bacterioclorofila-a es el pigmento más abundante en ellos, ya no hay rastros de clorofila-a, otro resultado que apoya la idea de que estamos cerca de lograr la aislación de estos organismos.
Para el segundo semestre estaremos trabajando con la posible secuenciación de unos clones relacionados con las muestras, la optimización de la amplificación del gene pufM y la posible secuenciación de esos resultados del PCR.
